MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS7

Total Repeats: 1250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019431	TGA	2	6	21	26	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073261
2	NC_019431	TGC	2	6	108	113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073261
3	NC_019431	GA	3	6	150	155	50 %	0 %	50 %	0 %	414073261
4	NC_019431	A	6	6	272	277	100 %	0 %	0 %	0 %	414073261
5	NC_019431	ATG	3	9	338	346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073261
6	NC_019431	AATA	2	8	369	376	75 %	25 %	0 %	0 %	414073261
7	NC_019431	A	6	6	406	411	100 %	0 %	0 %	0 %	414073261
8	NC_019431	TGAT	2	8	476	483	25 %	50 %	25 %	0 %	414073261
9	NC_019431	CAA	2	6	561	566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073261
10	NC_019431	TGA	2	6	651	656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073261
11	NC_019431	A	7	7	664	670	100 %	0 %	0 %	0 %	414073261
12	NC_019431	AAG	2	6	692	697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073261
13	NC_019431	A	6	6	732	737	100 %	0 %	0 %	0 %	414073261
14	NC_019431	A	6	6	742	747	100 %	0 %	0 %	0 %	414073261
15	NC_019431	GAA	2	6	845	850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073261
16	NC_019431	GCA	2	6	899	904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073261
17	NC_019431	AT	3	6	908	913	50 %	50 %	0 %	0 %	414073261
18	NC_019431	CTT	2	6	929	934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073261
19	NC_019431	AAT	2	6	1032	1037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073261
20	NC_019431	ATT	2	6	1052	1057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073261
21	NC_019431	GAT	2	6	1078	1083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073261
22	NC_019431	CTT	2	6	1090	1095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073261
23	NC_019431	GTG	2	6	1121	1126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073261
24	NC_019431	TAA	2	6	1200	1205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073261
25	NC_019431	GTT	2	6	1219	1224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073261
26	NC_019431	AAAT	2	8	1230	1237	75 %	25 %	0 %	0 %	414073261
27	NC_019431	AAC	2	6	1260	1265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073261
28	NC_019431	AATG	2	8	1326	1333	50 %	25 %	25 %	0 %	414073261
29	NC_019431	TAAA	2	8	1347	1354	75 %	25 %	0 %	0 %	414073261
30	NC_019431	A	8	8	1383	1390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019431	T	7	7	1409	1415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019431	AT	3	6	1423	1428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019431	A	8	8	1446	1453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019431	AG	3	6	1507	1512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019431	AAGT	2	8	1522	1529	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019431	AATT	2	8	1537	1544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019431	A	7	7	1577	1583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019431	ATAA	2	8	1670	1677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019431	TTTA	2	8	1764	1771	25 %	75 %	0 %	0 %	414073262
40	NC_019431	TCG	2	6	1972	1977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073262
41	NC_019431	TAT	2	6	2056	2061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073262
42	NC_019431	CCA	2	6	2148	2153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414073262
43	NC_019431	TTA	2	6	2361	2366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073262
44	NC_019431	GAA	2	6	2386	2391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073262
45	NC_019431	TTC	2	6	2491	2496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073262
46	NC_019431	AAT	2	6	2616	2621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073262
47	NC_019431	TA	3	6	2685	2690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019431	A	6	6	2690	2695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019431	CTT	2	6	2772	2777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019431	AAT	2	6	2845	2850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019431	GAA	2	6	2892	2897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019431	GAT	2	6	2954	2959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019431	TGGT	2	8	2974	2981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019431	A	6	6	3000	3005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019431	A	7	7	3050	3056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019431	ATAA	2	8	3125	3132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019431	AG	3	6	3138	3143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019431	ACA	3	9	3194	3202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073263
59	NC_019431	TTGA	2	8	3251	3258	25 %	50 %	25 %	0 %	414073263
60	NC_019431	CAA	2	6	3279	3284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073263
61	NC_019431	TGA	2	6	3346	3351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073263
62	NC_019431	GAT	2	6	3359	3364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073263
63	NC_019431	ATTC	2	8	3453	3460	25 %	50 %	0 %	25 %	414073263
64	NC_019431	TCA	2	6	3470	3475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073263
65	NC_019431	A	7	7	3484	3490	100 %	0 %	0 %	0 %	414073263
66	NC_019431	ATT	2	6	3519	3524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073263
67	NC_019431	TAT	2	6	3526	3531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073263
68	NC_019431	CAA	2	6	3543	3548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073263
69	NC_019431	ATT	3	9	3569	3577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073263
70	NC_019431	TGA	2	6	3583	3588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073263
71	NC_019431	ATC	2	6	3593	3598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073263
72	NC_019431	ATCA	2	8	3653	3660	50 %	25 %	0 %	25 %	414073263
73	NC_019431	ATT	2	6	3662	3667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073263
74	NC_019431	GAT	2	6	3668	3673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073263
75	NC_019431	ATA	2	6	3723	3728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073263
76	NC_019431	ACA	2	6	3773	3778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073263
77	NC_019431	GAT	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073263
78	NC_019431	TGA	2	6	3883	3888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073263
79	NC_019431	A	6	6	3906	3911	100 %	0 %	0 %	0 %	414073263
80	NC_019431	A	8	8	3964	3971	100 %	0 %	0 %	0 %	414073264
81	NC_019431	A	6	6	3979	3984	100 %	0 %	0 %	0 %	414073264
82	NC_019431	GAG	2	6	3995	4000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414073264
83	NC_019431	AAC	2	6	4019	4024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073264
84	NC_019431	TTA	2	6	4076	4081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073264
85	NC_019431	AAC	2	6	4098	4103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073264
86	NC_019431	ATTG	2	8	4123	4130	25 %	50 %	25 %	0 %	414073264
87	NC_019431	A	6	6	4157	4162	100 %	0 %	0 %	0 %	414073264
88	NC_019431	TGA	2	6	4216	4221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073264
89	NC_019431	CTCG	2	8	4275	4282	0 %	25 %	25 %	50 %	414073264
90	NC_019431	AGA	3	9	4297	4305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073264
91	NC_019431	A	6	6	4305	4310	100 %	0 %	0 %	0 %	414073264
92	NC_019431	CAT	2	6	4315	4320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073264
93	NC_019431	TGA	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073264
94	NC_019431	A	6	6	4352	4357	100 %	0 %	0 %	0 %	414073264
95	NC_019431	GAA	2	6	4481	4486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073264
96	NC_019431	GAA	3	9	4589	4597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073264
97	NC_019431	A	6	6	4610	4615	100 %	0 %	0 %	0 %	414073264
98	NC_019431	TTGA	2	8	4616	4623	25 %	50 %	25 %	0 %	414073264
99	NC_019431	GTT	2	6	4624	4629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073264
100	NC_019431	TTTA	2	8	4664	4671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019431	ATT	2	6	4738	4743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019431	ATTTA	2	10	4774	4783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019431	TGAT	2	8	4789	4796	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019431	ATG	2	6	4855	4860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019431	ATC	2	6	4882	4887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019431	T	7	7	4888	4894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019431	TCA	2	6	4952	4957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019431	TCC	2	6	5024	5029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414073265
109	NC_019431	TGC	2	6	5041	5046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073265
110	NC_019431	ACT	2	6	5098	5103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073265
111	NC_019431	GAAA	2	8	5117	5124	75 %	0 %	25 %	0 %	414073265
112	NC_019431	TCA	2	6	5144	5149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073265
113	NC_019431	TTA	2	6	5177	5182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073265
114	NC_019431	AG	3	6	5212	5217	50 %	0 %	50 %	0 %	414073265
115	NC_019431	AGA	2	6	5368	5373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073265
116	NC_019431	AGC	2	6	5389	5394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073265
117	NC_019431	TTGC	2	8	5414	5421	0 %	50 %	25 %	25 %	414073265
118	NC_019431	TAG	2	6	5538	5543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073265
119	NC_019431	A	6	6	5597	5602	100 %	0 %	0 %	0 %	414073265
120	NC_019431	GTTT	2	8	5685	5692	0 %	75 %	25 %	0 %	414073265
121	NC_019431	TTA	2	6	5756	5761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073265
122	NC_019431	GCAA	2	8	5834	5841	50 %	0 %	25 %	25 %	414073265
123	NC_019431	TCCCA	2	10	5851	5860	20 %	20 %	0 %	60 %	414073265
124	NC_019431	GAA	3	9	5953	5961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073265
125	NC_019431	A	6	6	5984	5989	100 %	0 %	0 %	0 %	414073265
126	NC_019431	TCA	2	6	5993	5998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073265
127	NC_019431	TCA	2	6	6017	6022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073265
128	NC_019431	GGA	2	6	6089	6094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414073265
129	NC_019431	T	6	6	6271	6276	0 %	100 %	0 %	0 %	414073265
130	NC_019431	ACG	2	6	6421	6426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073265
131	NC_019431	AGT	2	6	6438	6443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073265
132	NC_019431	TATT	2	8	6449	6456	25 %	75 %	0 %	0 %	414073265
133	NC_019431	TCC	2	6	6478	6483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_019431	T	7	7	6519	6525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019431	A	6	6	6541	6546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019431	TGTTAT	2	12	6566	6577	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019431	TCCT	2	8	6601	6608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019431	GAG	2	6	6657	6662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019431	AAT	2	6	6664	6669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019431	GAAT	2	8	6699	6706	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019431	GGA	2	6	6719	6724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_019431	ACC	2	6	13424	13429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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281	NC_019431	TCA	2	6	13460	13465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_019431	TAA	2	6	13499	13504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_019431	AAGA	2	8	13505	13512	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
284	NC_019431	TTG	2	6	13652	13657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_019431	TAA	2	6	13750	13755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073270
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